CO2培養箱的隔熱采用水套式和氣套式兩種類型。氣套式采用隔熱系統和表面散熱元件使培養箱內溫度均衡，但是因為外部電熱系統分布不均衡可導致培養箱內上下溫度不一至，溫差相對較大。水套式需要用戶在安裝培養箱時培養箱壁的空間內灌入大量蒸餾水。由于水的比熱容很高，水套式的優點是有助于均勻散熱和避免形成冷區，以及在斷電后能夠比較好的減緩培養箱內溫度的降低。水套式因4周環水，所以溫度均勻性很好。新型的CO2培養箱大多采用水套式。